はい。InSiteはAzure AD Multi-Factor Authenticationに対応しています。

現在対応している多要素認証はAzure AD Multi-Factor Authenticationのみです。
対象はInSite管理者アカウントに設定するSharePointサインインアカウントです。
※全体管理者アカウントは対象外ですが、今後対応を予定しております。

※InSiteの多要素認証機能は2021年3月26日にリリースした機能です。
本機能の利用には認証ファイルの作成が必要です。詳細はマニュアルの以下ページをご参照ください。

■マニュアル：【InSite管理マニュアル_オプション設定編（6. 多要素認証設定）】

※Azure AD Multi-Factor Authenticationの詳細は、以下 Microsoft サポートページをご参照ください。

■動作のしくみ: Azure AD Multi-Factor Authentication
https://docs.microsoft.com/ja-jp/azure/active-directory/authentication/concept-mfa-howitworks